Het belangrijkste verschil is het verschil in het actieve materiaal. Het actieve materiaal van de secundaire batterij is omkeerbaar, terwijl het actieve materiaal van de primaire batterij niet omkeerbaar is. De zelfontlading van de primaire batterij is veel kleiner dan die van de secundaire batterij, maar de interne weerstand is veel groter dan die van de secundaire batterij, waardoor het laadvermogen lager is.
Bovendien zijn de massaspecifieke capaciteit en volumespecifieke capaciteit van de primaire batterij groter dan die van algemene oplaadbare batterijen.
